Confirel a été fondée en 2001 par le Dr Hay Ly Eang — cinq ans après avoir fondé le laboratoire pharmaceutique PPM — sur la conviction que les terroirs et le savoir-faire rural cambodgiens, ainsi que les ingrédients locaux, pouvaient devenir des produits à plus forte valeur ajoutée grâce à la science, au contrôle qualité et à une production responsable.
Le nom Confirel porte cette même philosophie fondatrice. Lu lettre par lettre, ce sont huit engagements en un seul mot : conserver le patrimoine naturel, honorer l'identité originelle des produits locaux, ouvrir de nouvelles opportunités de développement, suivre une logique de production artisanale, ancrer l'innovation dans les ressources locales, rémunérer équitablement les parties prenantes, former et employer agriculteurs et personnel, et faire progresser les moyens de subsistance et la croissance économique qui en découlent. Ce ne sont pas des valeurs d'apparat — c'est la discipline derrière chaque produit que fabrique Confirel.
En collaboration avec des experts du CIRAD, le Dr Hay Ly Eang a développé un système de filtration et de stabilisation de la sève de palme Thnot qui a amélioré sa pureté, empêché une fermentation prématurée et préservé ses qualités. Cette avancée a permis de produire un sucre de palme conforme aux normes internationales de sécurité alimentaire, ouvrant la voie à la certification, aux marchés d'exportation et à la Palme d'Or de Natexpo Paris en 2005.